CHROMATIN REMODELING COMPLEX PBAF ACTIVATES AND REPRESSES INFLAMMATORY GENES

A. V. Feoktistov; Феоктистов А. В.; S. G. Georgieva; Георгиева С. Г.; N. V. Soshnikova; Сошникова Н. В.

doi:10.31857/S2686738923600462

Ремоделирующий хроматин комплекс PBAF участвует в активации и репрессии генов воспаления

Авторы: Феоктистов А.В.¹^,2, Георгиева С.Г.¹, Сошникова Н.В.¹^,2
Учреждения:
1. Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
2. Центр точного геномного редактирования и генетических технологий для биомедицины Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта
Выпуск: Том 513, № 1 (2023)
Страницы: 590-594
Раздел: Статьи
URL: https://vestnik.nvsu.ru/2686-7389/article/view/651061
DOI: https://doi.org/10.31857/S2686738923600462
EDN: https://elibrary.ru/GPQOZU
ID: 651061

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ
Доступ закрыт

Доступ предоставлен
Доступ закрыт

Только для подписчиков

Аннотация

Ремоделирующий хроматин комплекс PBAF является одним из важнейших регуляторов состояния хроматина и транскрипции генов у высших эукариот. В данной работе изучена роль PBAF в регуляции NF–κB – зависимой и JAK/STAT – зависимой активации генов воспаления. Показано, что разрушение модуля PBAF, отвечающего за его связывание с хроматином промотора гена, изменяет уровень транскрипции генов обоих путей. Показано, что PBAF может быть как активатором, так и репрессором генов воспаления. Таким образом, PBAF является одним из важных регуляторов экспрессии генов воспаления.

Ключевые слова

SWI/SNF, эукариотические факторы транскрипции, воспаление, NF–kB, Jak/STAT, экспрессия генов

Список литературы

Yuan J. et al., Structure of human chromatin-remodelling PBAF complex bound to a nucleosome, // Nature, 2022. V. 605. P. 166–171.
Centore R.C. et al., Mammalian SWI/SNF Chromatin Remodeling Complexes: Emerging Mechanisms and Therapeutic Strategies, // Trends in Genetics., 2020. V. 36. № 12. P. 936–950.
Ishizaka A. et al., Double plant homeodomain (PHD) finger proteins DPF3a and -3b are required as transcriptional co-activators in SWI/SNF complex-dependent activation of NF-κB RelA/p50 heterodimer, // Journal of Biological Chemistry., 2012. V. 287. № 15. P. 11924–11933.
Ramirez-Carrozzi V.R. et al., A unifying model for the selective regulation of inducible transcription by CpG islands and nucleosome remodeling // Cell., 2009. V. 138. № 1. P. 114–128.
Gioacchino Natoli, NF-κB and chromatin: ten years on the path from basic mechanisms to candidate drugs // Immunological Reviews., 2012. V. 246. № 1. P. 183–192.
Ramirez-Carrozzi V.R. et al., Selective and antagonistic functions of SWI/SNF and Mi-2β nucleosome remodeling complexes during an inflammatory response // Genes & Development., 2006. V. 20. P. 282–296.
Chen M. et al., CDK8/19 Mediator kinases potentiate induction of transcription by NfκB // PNAS., 2017. V. 114. № 38. P. 10208–10213.
Tatarskiy V.V. et al., Stability of the PHF10 subunit of PBAF signature module is regulated by phosphorylation: role of β-TrCP // Scientific Reports., 2017. V. 7. P. 5645.
Brechalov A.V. et al., Mammalian cells contain two functionally distinct PBAF complexes incorporating different isoforms of PHF10 signature subunit // Cell Cycle., 2014. V. 13. № 12. P. 1970–1979.
Soshnikova N.V. et al., PHF10 subunit of PBAF complex mediates transcriptional activation by MYC // Oncogene., 2021. V. 40. № 42. P. 6071–6080.
Vorobyeva N.E. et al., Transcription coactivator SAYP combines chromatin remodeler Brahma and transcription initiation factor TFIID into a single supercomplex // PNAS., 2009. V. 106. № 27. P. 11049–11054.
Min S. et al., Transcriptional regulation and chromatin dynamics at DNA double-strand breaks // Experimental & Molecular Medicine., 2022. V. 54. P. 1705–1712.
Musladin S. et al., The RSC chromatin remodeling complex has a crucial role in the complete remodeler set for yeast PHO5 promoter opening // Nucleic Acids Research., 2014. V. 42. № 7. P. 4270–4282.