<!DOCTYPE article
PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.4 20190208//EN"
       "JATS-journalpublishing1.dtd">
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" article-type="research-article" dtd-version="1.4" xml:lang="en">
 <front>
  <journal-meta>
   <journal-id journal-id-type="publisher-id">Bulletin of Nizhnevartovsk State University</journal-id>
   <journal-title-group>
    <journal-title xml:lang="en">Bulletin of Nizhnevartovsk State University</journal-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>Вестник Нижневартовского государственного университета</trans-title>
    </trans-title-group>
   </journal-title-group>
   <issn publication-format="print">2311-1402</issn>
   <issn publication-format="online">2686-8784</issn>
  </journal-meta>
  <article-meta>
   <article-id pub-id-type="publisher-id">112189</article-id>
   <article-id pub-id-type="doi">10.36906/2311-4444/24-2/07</article-id>
   <article-categories>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru">
     <subject>Экология животных</subject>
    </subj-group>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en">
     <subject>Animal Ecology</subject>
    </subj-group>
    <subj-group>
     <subject>Экология животных</subject>
    </subj-group>
   </article-categories>
   <title-group>
    <article-title xml:lang="en">Comparative analysis of the efficiency of methods for DNA extraction from animal tissues</article-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>Сравнительный анализ эффективности методов экстракции ДНК из тканей животных</trans-title>
    </trans-title-group>
   </title-group>
   <contrib-group content-type="authors">
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Филиппова</surname>
       <given-names>Ася Вячеславовна </given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Filippova</surname>
       <given-names>Asya V </given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>kassio-67@yandex.ru</email>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-1"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Рябухина</surname>
       <given-names>Мария Владимировна </given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Ryabukhina</surname>
       <given-names>Maria V </given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>marija-rjabuhina@mail.ru</email>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-2"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Одиноков</surname>
       <given-names>Георгий Николаевич </given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Odinokov</surname>
       <given-names>Georgy N </given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>marija-rjabuhina@mail.ru</email>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-3"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Карпова</surname>
       <given-names>Наталья Григорьевна </given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Karpova</surname>
       <given-names>Natalya G </given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>olo-natasha@yandex.ru</email>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-4"/>
    </contrib>
   </contrib-group>
   <aff-alternatives id="aff-1">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Оренбургский государственный аграрный университет</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Orenburg State Agrarian University</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-2">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Экспертно-криминалистический центр МВД России</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Forensic Center ofthe Ministry of Internal Affairs of Russia</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-3">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Экспертно-криминалистический центр МВД России</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Forensic Center ofthe Ministry of Internal Affairs of Russia</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-4">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Оренбургский государственный аграрный университет</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Orenburg State University</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <pub-date publication-format="print" date-type="pub" iso-8601-date="2024-06-25T00:35:14+03:00">
    <day>25</day>
    <month>06</month>
    <year>2024</year>
   </pub-date>
   <pub-date publication-format="electronic" date-type="pub" iso-8601-date="2024-06-25T00:35:14+03:00">
    <day>25</day>
    <month>06</month>
    <year>2024</year>
   </pub-date>
   <issue>2</issue>
   <fpage>76</fpage>
   <lpage>85</lpage>
   <history>
    <date date-type="received" iso-8601-date="2024-06-06T00:35:14+03:00">
     <day>06</day>
     <month>06</month>
     <year>2024</year>
    </date>
    <date date-type="accepted" iso-8601-date="2024-06-15T00:35:14+03:00">
     <day>15</day>
     <month>06</month>
     <year>2024</year>
    </date>
   </history>
   <self-uri xlink:href="https://vestnik.nvsu.ru/en/nauka/article/112189/view">https://vestnik.nvsu.ru/en/nauka/article/112189/view</self-uri>
   <abstract xml:lang="ru">
    <p>Впервые проведен сравнительный анализ эффективности методов экстракции ДНК, применяемых в экспертно-криминалистической практике, из различных тканей животных – костных рогов и копыт северного оленя &lt;i&gt;Rangifer tarandus&lt;/i&gt; (Linnaeus, 1758); скелетных мышц, хрящевой ткани и слизи радужной форели &lt;i&gt;Oncorhynchus mykkis&lt;/i&gt; (Walbaum, 1792); скелетных мышц и ребра домашней свиньи &lt;i&gt;Sus scrofa domesticus&lt;/i&gt; (Erxleben, 1777). Выделение ДНК проводили согласно протоколам производителей с помощью шести коммерческих наборов реагентов, отечественного производства, основанных на методе осаждения спиртом: «GM Tissue» («Raissol»), «Amex» («Raissol»); сорбции на магнитные частицы: «GM Tissue М» («Raissol»), «М-Сорб-кость» («Синтол»); сорбции на силикагель: «D-Tissues» («Биолабмикс»), «D-blood» («Биолабмикс»). Количественные и качественные характеристики полученной ДНК оценивали измерением концентрации духцепочечной ДНК на флуориметре Qubit 2.0 (Life Technologies, США), используя набор реагентов Qubit DNA HS Assay Kit. Наибольшая концентрация двухцепочечной ДНК, из всех типов тканей животных, была получена методом сорбции на магнитные частицы. С применением этого метода, были получены наиболее стабильные и воспроизводимые концентрации ДНК (средние значения – 474,00 мкг/мл, 268,00 мкг/мл, 83,20 мкг/мл и 69,70 мкг/мл, соответственно). С применение метода экстракции ДНК на основе осаждения спиртом, из всех типов тканей животных, были получены более низкие концентрации ДНК, в сравнении с методом сорбции на магнитные частицы. Однако применение данного метода показало достаточно высокую стабильность и воспроизводимость получаемых концентраций ДНК (средние значения – 120,00 мкг/мл, 110,00 мкг/мл и 99,90 мкг/мл, соответственно), из всех типов биологических тканей, во всех сериях (повторениях) этапа экстракции. Применение метода экстракции ДНК на основе сорбции на силикагель, показало в среднем более низкие концентрации целевой ДНК, из всех типов тканей животных, в сравнении с методами сорбции на магнитные частицы и осаждении спиртом. Данный метод отличался наиболее низкой стабильностью и воспроизводимостью получаемых концентраций ДНК (средние значения – 74,10 мкг/мл и 41,60 мкг/мл, соответственно). Таким образом, авторским коллективом проведена оценка эффективности методических подходов экстракции ДНК, относительно различных типов тканей животных, а также оценка стабильности и воспроизводимости полученных результатов. Ранее эффективность данных методических подходов не оценивалась.</p>
   </abstract>
   <trans-abstract xml:lang="en">
    <p>For the first time, a comparative analysis of the effectiveness of DNA extraction methods used in expert forensic practice from various animal tissues – bone antlers and hooves of reindeer &lt;i&gt;Rangifer tarandus&lt;/i&gt; (Linnaeus, 1758); skeletal muscle, cartilage tissue and mucus of rainbow trout &lt;i&gt;Oncorhynchus mykkis&lt;/i&gt; (Walbaum, 1792); skeletal muscles and ribs of the domestic pig &lt;i&gt;Sus scrofa domesticus&lt;/i&gt; (Erxleben, 1777). DNA extraction was carried out according to the manufacturers' protocols using six commercial reagent kits, domestically produced, based on the alcohol precipitation method: &quot;GM Tissue&quot; (Raissol), “Amex” (Raissol); sorption onto magnetic particles: “GM Tissue M” (“Raissol”), “M-Sorb-bone” (“Synthol”); sorption on silica gel: “D-Tissues” (“Biolabmix”), “D-blood” (“Biolabmix”). The quantitative and qualitative characteristics of the obtained DNA were assessed by measuring the concentration of double-stranded DNA on a Qubit 2.0 fluorometer (Life Technologies, USA) using the Qubit DNA HS Assay Kit. The highest concentration of double-stranded DNA of all types of animal tissue was obtained by sorption onto magnetic particles. Using this method, the most stable and reproducible DNA concentrations were obtained (average values – 474.00 μg/ml, 268.00 μg/ml, 83.20 μg/ml and 69.70 μg/ml, respectively). Using the method of DNA extraction based on precipitation with alcohol, lower concentrations of DNA were obtained from all types of animal tissues in comparison with the method of sorption onto magnetic particles. However, the use of this method has shown a fairly high stability and reproducibility of the obtained DNA concentrations (average values – 120.00 µg/ml, 110.00 µg/ml and 99.90 µg/ml, respectively), from all types of biological tissues, in all series (repetitions) of the extraction step. The use of a DNA extraction method based on sorption on silica gel showed, on average, lower concentrations of target DNA from all types of animal tissues, in comparison with the methods of sorption on magnetic particles and precipitation with alcohol. This method was characterized by the lowest stability and reproducibility of the obtained DNA concentrations (average values – 74.10 μg/ml and 41.60 μg/ml, respectively). Thus, the team of authors assessed the effectiveness of methodological approaches to DNA extraction in relation to various types of animal tissue, as well as assessed the stability and reproducibility of the results obtained. The effectiveness of these methodological approaches has not been previously assessed.</p>
   </trans-abstract>
   <kwd-group xml:lang="ru">
    <kwd>экстракция ДНК</kwd>
    <kwd>ткани животных</kwd>
    <kwd>силикагель</kwd>
    <kwd>магнитные частицы</kwd>
    <kwd>осаждение спиртом</kwd>
    <kwd>экспертно-криминалистическая практика</kwd>
   </kwd-group>
  </article-meta>
 </front>
 <body>
  <p></p>
 </body>
 <back>
  <ref-list/>
 </back>
</article>
