Konformatsionnoe raznoobrazie lipidov

Мұқаба

Дәйексөз келтіру

Толық мәтін

Ашық рұқсат Ашық рұқсат
Рұқсат жабық Рұқсат берілді
Рұқсат жабық Тек жазылушылар үшін

Аннотация

В работе исследуется конформационное разнообразие гидрофобных цепей липидов. Даются ответы на вопросы: сколько всего возможно конформаций липидной цепи и сколько из них может реализоваться в реальной системе. Предлагается подход к анализу конформаций липидных молекул, основанный на теории множеств, и вводится равенство, связывающее наборы реализованных в липидной системе конформаций с энергией системы. С помощью теории множеств рассматривается вопрос о том, какие конформации гидрофобных цепей липидов могут быть реализованы в реальной системе. Сформулировано понятие ключевой конформации, позволяющее оценивать зависимость между структурными характеристиками липидов и энергетическими характеристиками мембран.

Авторлар туралы

I. Boldyrev

Институт физической химии и электрохимии им. А.Н.Фрумкина РАН

Email: i_boldyrev@mail.ru
Москва, Россия

Әдебиет тізімі

  1. T. Harayama and H. Riezman, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 19(5), 281 (2018).
  2. H. Sunshine and M. L. Iruela-Arispe, Current Opinion in Lipidology 28(5), 408 (2017).
  3. X. Wang, Current opinion in plant biology 7(3), 329 (20040.
  4. D. Casares, P. V. Escribá, and C. A. Rosselló, Int. J. Mol. Sci. 20(9), 2167 (2019).
  5. B. de Kruijff, Current Opinion in Chemical Biology 1(4), 564 (1997).
  6. V. A. Frolov, A. V. Shnyrova, and J. Zimmerberg, Cold Spring Harbor Persp ectives in Biology 3(11), a004747 (2011).
  7. J. Seeling, Q. Rev. Biophys. 10, 353 (1977).
  8. J. H. Davis, BBA Reviews on Biomembranes 737(1), 117 (1983).
  9. T. Molugu, S. Lee, and M. Brown, Chem. Rev. 117(19), 12087 (2017).
  10. A. Leftin and M. Brown, Biochimica et Biophysica Acta Biomembranes 1808(3), 818 (2011).
  11. S. Marčelja, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) -Biomembranes 367(2), 165 (1974).
  12. P. De Gennes, Phys. Lett. A 47(2), 123 (1974).
  13. W. Helfrich, Z. Naturforsch. 28(11-12), 693 (1973).
  14. Z. Tu and Z. Ou-Yang, Adv. Colloid Interface Sci. 208, 66 (2014).
  15. S. May, ‘Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 5(3-4), 244 (2000).
  16. J. F. Nagle, J. Chem. Phys. 58(1), 252 (1973).
  17. H. Scott and W.-H. Cheng, Biophysical Journal 28(1), 117 (1979).
  18. A. Caille, A. Rapini, M. Zuckermann, A. Cros, and S. Doniach, Can. J. Phys. 56(3), 348 (1978).
  19. M. Hamm and M. Kozlov, Eur. Phys. J. E3, 323 (2000).
  20. S. I. Mukhin and S. Baoukina, Physical. Rev. E 71(6), 061918 (2005).
  21. S. I. Mukhin and B. B. Kheyfets, Phys. Rev. E 82(5), 051901 (2010).
  22. B. Kheyfets, T. Galimzyanov, and S. Mukhin, JETP Lett. 107, 718 (2018).
  23. A. Drozdova and S. Mukhin, JETP 125, 357 (2017).
  24. S. A. Akimov, P. E. Volynsky, T. R. Galimzyanov, P. I. Kuzmin, K. V. Pavlov, and O. V. Batishchev, Sci. Rep. 7(1), 12152 (2017).
  25. S. Akimov, P. Volynsky, T. Galimzyanov, P. Kuzmin, K. Pavlov, and O. Batishchev, Sci. Rep. 7(1), 12509 (2017).
  26. O. G. Mouritsen and M. Bloom, Annual Review of Biophysics and Biomolecular structure 22(1), 145 (1993).
  27. M. F. Brown, Biochemistry 51(49), 9782 (2012).
  28. S. A. Akimov, P. I. Kuzmin, J. Zimmerberg, and F. S. Cohen, Phys. Rev. E 75(1), 011919 (2007).
  29. T. R. Galimzyanov, R. J. Molotkovsky, M. E. Bozdaganyan, F. S. Cohen, P. Pohl, and S. A. Akimov, Phys. Rev. Lett. 115(8), 088101 (2015).
  30. S. E. Feller, Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 5(3-4), 217 (2000).
  31. R. M. Venable, F. L. Brown, and R. W. Pastor, Chemistry and Physics of Lipids 192, 60 (2015).
  32. R. M. Venable, A. Kramer, and R. W. Pastor, Chem. Rev. 119(9), 5954 (2019).
  33. L. S. Vermeer, B. L. De Groot, V. Réat, A. Milon, and J. Czaplicki, Eur. Biophys. J. 36(8), 919 (2007).
  34. K. V. Pinigin, Membranes 12(11), 1149 (2022).
  35. A. Semenova, A. Chugunov, P. Dubovskii, V. Chupin, P. Volynsky, and I. Boldyrev, Chemistry and Physics of Lipids 165(4), 382 (2012).
  36. O. Batishchev, A. Alekseeva, D. Tretiakova, T. Galimzyanov, A. Chernyadyev, N. Onishchenko, P. Volynsky, and I. Boldyrev, Soft Matter 16(13), 3216 (2020).
  37. S. E. Feller, K. Gawrisch, and A. D. MacKerell, J. Am. Chem. Soc. 124(2), 318 (2002).
  38. T. Gocen, S. H. Bayari, and M. H. Guven, J. Mol. Struct. 1150, 68 (2017).
  39. M. R. Rich, Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Molecular Cell Research 1178(1), 87 (1993).
  40. I. Kanesaka, R. G. Snyder, and H. L. Strauss, J. Chem. Phys. 84(1), 395 (1986).

Қосымша файлдар

Қосымша файлдар
Әрекет
1. JATS XML
Жүктеу

© Российская академия наук, 2024